Dê o primeiro passo rumo a um futuro de inovação e excelência
Leandro de Mattos Pereira
Bioinformática, IA aplicada à ciência de dados ômicos e consultoria em análises avançadas.
- Genômica, transcriptômica, proteômica e metagenômica
- Machine learning, NLP, deep learning e pipelines reprodutíveis
- Treinamentos, consultorias e projetos de P&D
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Impacto e diferenciais
Foco em resultados aplicados, eficiência de análise e capacitação de equipes multidisciplinares.
+15 anos
de experiência combinada em bioinformática e análise de dados ômicos.
Projetos internacionais
colaborações com universidades, centros de pesquisa e empresas.
IA aplicada
modelos preditivos e NLP para acelerar descoberta científica.
Treinamentos customizados
do básico ao avançado, com foco em prática e reprodutibilidade.
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Sobre
Pesquisador e consultor com trajetória em bioinformática, biologia computacional e ciência de dados aplicada à saúde, biodiversidade e biotecnologia.
Experiência
Experiência em projetos nacionais e internacionais de bioinformática e biologia computacional, com atuação em genômica comparativa, filogenômica, metagenômica, microbiomas e análise de dados ômicos, aliadas ao uso de inteligência artificial para descoberta de enzimas, anotação funcional e predição de especificidade de substratos.
Desenvolvimento de pipelines reprodutíveis para análise de genomas, metagenomas, transcriptomas, microbiomas e outros dados ômicos.
Modelagem preditiva, aprendizagem supervisionada e não supervisionada, além de NLP aplicado às ciências da vida.
Desenvolvimento de aplicações e soluções computacionais com Python, R, SQL/PostgreSQL, Flask, Streamlit, Galaxy e ferramentas de automação científica.
Leandro de Mattos Pereira
Leandro de Mattos Pereira Sou pesquisador e biólogo (CRBio-2 143240), com doutorado em Biologia Computacional e de Sistemas pela Fiocruz (RJ), mestrado em Biociências e Biotecnologia pela UENF e graduação em Ciências Biológicas pela UENF, com ênfase em Biotecnologia. Realizei ainda seis pós-doutorados — na PUCRS, HCPA, UFRJ, Fiocruz, ITV e CIIMAR (Portugal) — na área de Bioinformática aplicada à Parasitologia, Microbiologia, Virologia e Biotecnologia. Atuo em bioinformática e análise de dados ômicos (genômica, transcriptômica, proteômica e metagenômica), com experiência em anotação funcional, descoberta de enzimas, reconstrução de vias metabólicas, genômica comparativa e filogenômica, mineração de clusters de genes biossintéticos (BGCs), análises de metabarcoding e análises estatísticas para índices ecológicos de diversidade. Trabalho principalmente com Python e R, aplicando metodologias de ciência de dados e aprendizado de máquina — desde métodos clássicos (Random Forest, SVM e redes neurais profundas) até LLMs (como GPT-J), incluindo fine-tuning e RAG.
Desenvolvo pipelines de ponta a ponta — desde a aquisição e curadoria de dados, passando pelo processamento e modelagem, até a disponibilização de resultados em soluções do tipo Software as a Service (SaaS), incluindo configuração de ambientes, configuração da infraestrutura de rede e implantação em produção. Esses pipelines integram machine learning clássico com modelos baseados em transformers (por exemplo, BERT e ESM2) e abordagens baseadas em embeddings (como word2vec) para prever a especificidade de substrato de enzimas. Tenho interesse em integrar Bioinformática e IA para gerar conhecimento aplicável, com impacto em biotecnologia, preservação ambiental e desenvolvimento sustentável.
LinkedIn GitHubServiços & Consultoria
Projetos sob medida para instituições de pesquisa, estudantes, empresas e laboratórios.
Genômica e Metagenômica Aplicadas à Biotecnologia
Desenvolvimento de programas e pipelines customizados para mineração de genomas e metagenomas, com uso de Bioinformática e Inteligência Artificial para prospecção in silico de microrganismos benéficos e genes com potencial funcional e biotecnológico.
Exemplo de pesquisa relacionada:
IA e Bioinformática para Descoberta de Enzimas e Produtos Naturais
Aplicação de Bioinformática e IA para anotação funcional em larga escala, priorização de enzimas e exploração do potencial biossintético de microrganismos.
- Anotação funcional de enzimas CAZymes em genomas e metagenomas para aplicações industriais.
- Mineração de genomas e metagenomas para identificação de BGCs e famílias de gene clusters.
- Predição de especificidade de substratos de enzimas usando Bioinformática e IA.
- Análises filogenéticas de proteínas.
Exemplo de pesquisa relacionada:
Genômica Comparativa e Filogenômica
Automatização de acesso a bases de dados públicas e obtenção de dados em larga escala, incluindo genomas e proteomas, com comparação genômica por pipelines customizados, análises filogenômicas e geração de relatórios interpretativos.
Diversidade genetica e Análise de Comunidades
Análises de comunidades microbianas e ecológicas a partir de dados de metabarcoding ou metagenômica, com foco em perfil taxonômico, diversidade e identificação de padrões entre grupos.
- Classificação taxonômica e perfil de comunidades.
- Diversidade alfa e beta.
- Análises de ordenação e clustering de comunidades, como NMDS, PCoA e outras.
- Análises de abundância diferencial para identificação de padrões ecológicos e diferenças entre grupos.
Mentoria Estratégica e Capacitação
Planejamento de pesquisa, revisão de pipelines e capacitação de equipes técnicas em análises bioinformáticas aplicadas a artigos, dissertações e teses.
- Planejamento das análises.
- Mapeamento do fluxo de trabalho.
- Revisão técnica de pipelines.
- Treinamento customizado.
Disponibilidade e escopo sob avaliação prévia.
Como posso ajudar sua organização?
Transformo dados complexos em decisões claras, com entregas estruturadas e comunicação objetiva.
Diagnóstico de dados
Mapeio o fluxo atual, identifico gargalos e proponho melhorias com ganho de produtividade.
Pipeline reprodutível
Desenvolvo soluções de bioinformática com documentação, versionamento e automação para equipes técnicas.
Entrega estratégica
Relatórios e dashboards claros para gestores, cientistas e decisores.
Programas em Destaque
Projetos estruturados para acelerar resultados e inovação científica.
Programa Genômica & IA
Pipeline completo de dados até insights, com acompanhamento técnico especializado.
Treinamentos personalizados em Bioinformática
Com abordagem teórica e prática, aplicados a análises de metabarcoding de DNA ambiental (eDNA) e análises filogenéticas para empresas e grupos de pesquisa, oferecidos em formato remoto ou presencial.
Capacitação de Equipes
Treinamentos hands-on com foco em ferramentas modernas e boas práticas.
Consultoria Estratégica
Diagnóstico de necessidades, desenho de experimentos e planejamento de projetos.
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